Moșia de la Măgurele a avut de-a lungul timpului numeroși proprietari, una dintre cele mai importante familii care au stăpânit-o fiind cu siguranță cea a Cantacuzinilor. În momentul în care aceștia au decis să o înstrăineze, o bună parte din ea a fost cumpărată de către Ioan Oteteleșanu.
După ce atât Ioan, cât și soția sa, Elena Oteteleșanu au murit la sfârșitul secolului al XIX-lea, terenul împreună cu frumosul conac au intrat în posesia lui Ioan Kalinderu, administratorul averii Oteteleșanu și membru al Academiei Române, care în 1893 a donat toată averea familiei Oteteleșanu Academiei Române. Respectând dorința vechilor propretari, spațiile conacului au fost folosite pentru a adăposti aici un institut de fete. Cu acest prilej, conacul a fost restaurat și modificat pentru a adăposti noua funcțiune, în 1898 fiindu-i anexate încă două corpuri.
În perioada 1945-1950, conacul a suferit unele transformări pentru a putea adăposti Institutul de Fizică Atomică. În prezent, acesta se află în administrarea Institutului Național de Cercetare – Dezvoltare pentru Fizica Materialelor.